YRC Logo
PROTEIN SEARCH:
Descriptions Names[Advanced Search]

View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: gi|71747796
Protein type: Transmembrane with Signal Peptide
Type Confidence: 0.93
Topology Confidence: 0.88
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MSAKYYIPLF MTVLFTSTAC VPGMANEAGP IFEESNAEVA TPPADAVHDD FFFDYKNATG  60
   61 YADDCNITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 120
  121 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CDITGDCNET DDCNITGDCN 180
  181 ETDDCDITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 240
  241 ETDDCDITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CDITGDCNET DDCNITGDCN 300
  301 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CDITGDCNET DDCNITGDCN 360
  361 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 420
  421 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 480
  481 ETDDCNITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 540
  541 ETDDCDITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 600
  601 ETDDCNITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 660
  661 ETDDCNITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 720
  721 ETDDCDITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 780
  781 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCDITGDCN 840
  841 ETDDCNITGD CNETDDCDIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 900
  901 ETDDCNITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCD ITGDCNETDD CNITGDCNET DDCNITGDCN 960
  961 ETDDCDITGD CNETDDCNIT GDCNETDDCN ITGDCNETDD CDITGDCNET DDCNITGDCN1020
 1021 ETDDCDITGD CNDTEVSDAA DGTDGMFLKS SCSLKLVAFC DGCSTEDSPK FSNAKGKGSS1080
 1081 VSAGLLLLVG STFLLLAVGL SAVLFLGRER QNAVVICDNE VMMEEVPRCL SDASFAVPVT1140
 1141 QSSDEAKP
YRC Informatics Platform - Version 3.0
Created and Maintained by: Michael Riffle