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View Philius Transmembrane Prediction Details

Prediction Overview

Protein: SPBPJ4664.02
Protein type: Transmembrane with Signal Peptide
Type Confidence: 0.90
Topology Confidence: 0.51
From Publication: Reynolds et al. (2008)


Predicted Protein Segments [Show List]:

Prediction Image Map

(Place mouse over segments for confidence values.)


Philius confidence legend

Prediction Sequence Map

Legend: Transmembrane Helix, Non-Cytoplasmic, Cytoplasmic, Signal Peptide

(Place mouse over sequence for confidence values.)

      1          11         21         31         41         51         
      |          |          |          |          |          |          
    1 MVEKTSPILI TLCIFLLIPI SSALPFQTFE ESLKLKSNIS HTGSFFANLS QSYSSTSIIH  60
   61 SVSSPVDCSL DVNNQINTIN ITSVSAGTNE LFLPTLSHAH ANDREASLFF PYTDIRYNGF 120
  121 PEPSNTDSTS ILSFNTIRLI PSTNVINTSH YKGFNRYPTI SSTVKVGKRA ATASFSYTNV 180
  181 SSSVIATAYT SASSTILSSP SVEQSTPSII TQTESSTTTE GSSVASSEST IANSDQSSFI 240
  241 TYESTQNPTA NKTDASQQST ESTSSSASAY SYITTLQTAT TAQQTTSENT YSTSGPNLTT 300
  301 SNTSPQISST ISSSSFIVES PSVALSTSST TTITNASTPA ANTIISRSSK PTDTTNSISF 360
  361 ANTTPENTST QITSPTAVNS STPITSSSVL NSSTPITSSS ILNTSTPITS SSVLNSSTPI 420
  421 TSSSILNSST PITSSTVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS SSVLNSSTPI 480
  481 TSSTVVNTST PITSSTVVNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STALNTSTSI 540
  541 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITR YSVLNSSTPI 600
  601 TSSTVLNSST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS SSVLNSSTPI 660
  661 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTAITS STALNTSTPI 720
  721 TSSSVLNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSSS ILNSSTPITS SSVLNSSTPI 780
  781 TSSTVVNTST PITSSSVLNS STPITSSTVL NSSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI 840
  841 TSSTVVNSST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI 900
  901 TSSTVVNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST GLNTSTPITS SSVLNSSTPI 960
  961 TSSTVLNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSSS VLNTSTPITS SSVLNSSTAI1020
 1021 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTVV NTSTPITSST VVNSSTPITS STALNTSTPI1080
 1081 TSSSVLNSST PITSSTVLNS STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STALNTSTPI1140
 1141 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSTVV NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNTSTPI1200
 1201 TSSTVVNSST PITSSTVLNT STPITSSSVL NSSTPITSSS ILNSSTPITS SSVLNSSTPI1260
 1261 TSSTVVNSST PITSSTALNT SIPITSSSVL NSSTPITSST ALNTSTSITS SSVLNSSTPI1320
 1321 TSSTVVNTST PITSSSVLNS STPITSSTVV NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNTSTPI1380
 1381 TSSTVVNSST PITSSTVLNS STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI1440
 1441 TSSTVVNTST PITSSSVLNS STPITSSTVV NTSTPITSST VVNSSTPITS STVVNTSTPI1500
 1501 TSSTVVNTST PITSSTVVNS STPITSSTVL NTSTPITSSS VLNSSTPITS SSVLNSSTPI1560
 1561 TSSTVVNTST PITSSSVVNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STALNTSTPI1620
 1621 TSSSVLNSST PITSSTVLNS STPITSSTAL NTSPPITSST VVNSSTPITS STVVNTSTPI1680
 1681 TSSTVVNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI1740
 1741 TSSTVVNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST ALNTSTPITS SSVLNSSTPI1800
 1801 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTVV NTSTPITSST VVNSSTPITS STALNTSTPI1860
 1861 TSSSVLNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST VLNSSTPITS STALNTSTPI1920
 1921 TSSSVLNSST PITSSSVLNS STPITSSTVV NSSTPITSSS VLNSSTPITS STALNTSTPI1980
 1981 TSSSVLNSST PITSSSVLNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI2040
 2041 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STVLNSSTPI2100
 2101 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSSVL NSSTPITSST VVNSSTPITS SSVLNSSTPI2160
 2161 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTVV NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNTSTPI2220
 2221 TSSTVVNSST PITSSTVLNS STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI2280
 2281 TSSTVVNTST PITSSTVVNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI2340
 2341 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSTAL NTSTSITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI2400
 2401 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STSITSSSVL NSSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNSSTPI2460
 2461 TSSSVLNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI2520
 2521 TSSTVLNSST PITSSSVLNS STPITSSTVV NTSTPITSST VVNSSTPITS LTALNSSTPI2580
 2581 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSTVV NSSTPITSST ALNTSTPITS SSVLNSSTPI2640
 2641 TSSTALNTST SITSSSVLNS STPITSSTVV NTSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI2700
 2701 TSSTVVNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS SSVLNSSTPI2760
 2761 TSSTVVNTST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI2820
 2821 TSSTVLNSST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STALNTSTSI2880
 2881 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI2940
 2941 TSSTALNTST PITSSSVLNS STPITSSTAL NTSTSITSSS VLNSSTPITS STVVNTSTPI3000
 3001 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSTVV NSSTPITSST ALNTSTPITS STVLNSSTPI3060
 3061 TSSSVLNSST PITSSTALNT STPITSSSVL NSSTAITSSS IVNSSTPITS SSVLNSSTAI3120
 3121 TSSSILNSST PITSSSILNS STPITSSTVV NSSTPITSST TLNTSTPITS SSVLNSSTAI3180
 3181 TSSSIVNSST PITSSSVLNS STPITSSTTL NTSTPITSSS VLNSSTAITS SSVLNSSTPI3240
 3241 TSSSVLNSST PITSSTVVNT STPITSSSVL NSSTPITSST VVNTSTPITS STVVNSSTPI3300
 3301 TSSTTLNTST PITSSSVLNS STAITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTAITS SSILNSSTPV3360
 3361 TSSSVLNSST PITSSTVVNS STPITSSTAL NTSTPITSSS VLNSSTPITS STVVNSSTPI3420
 3421 TSSTALNTST PITSSTVVNS STPITSSSVL NSSTAIASSS ILNSSTPITS SSVLNSSTPI3480
 3481 SSSTVITSSV VIGSSSVLSY ASSIVSSVSL NSSLLSSSGG FSSSAFSTGS SSFSLTSENG3540
 3541 SVSSSSLVSS SPVLSGYSES SFDSSVFVPS SVSRSFSYSR FSSGSLDSSS VFNSTTVSTA3600
 3601 SGISQGSVLS STRAIESEST ASHRSSVLSE LSSYDLSTSA FSSSSSEPST LDYSVSSSSL3660
 3661 SSSIGVGSSF SSNSKVTSNK VPSTVSPHSS SISDTKSPAT VTISSSSGQF THSTFSTGST3720
 3721 MHNTVSHATS TSSSFTTSHL PTNTLASTFD NSQSIFSSSS GVPGLSTKSS SLGKIGSSSI3780
 3781 SLTLSSSSIR DAELPTPSRM TSPSLSETIP QSSSISEAST SNPNILSSTV LSFDSTITNS3840
 3841 FTTASTSIMK TTSLNSNSYK WYNSTTQSVY YNATSSTVPW SNSTFRNTSN TMTSRFVSND3900
 3901 FNSTISLQPV VQFNNFTKRE ITTILITASD GSAVTTSLST FYSASSLASS VVKPLYILST3960
 3961 FFVAAVFFII F

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